帅帅男孩 发表于 2015-11-30 07:28:27

和声搜索算法-python实现

  HSIndividual.py



1 import numpy as np
2 import ObjFunction
3
4
5 class HSIndividual:
6
7   '''
8   individual of harmony search algorithm
9   '''
10
11   def __init__(self,vardim, bound):
12         '''
13         vardim: dimension of variables
14         bound: boundaries of variables
15         '''
16         self.vardim = vardim
17         self.bound = bound
18         self.fitness = 0.
19
20   def generate(self):
21         '''
22         generate a random chromsome for harmony search algorithm
23         '''
24         len = self.vardim
25         rnd = np.random.random(size=len)
26         self.chrom = np.zeros(len)
27         for i in xrange(0, len):
28             self.chrom = self.bound + \
29               (self.bound - self.bound) * rnd
30
31   def calculateFitness(self):
32         '''
33         calculate the fitness of the chromsome
34         '''
35         self.fitness = ObjFunction.GrieFunc(
36             self.vardim, self.chrom, self.bound)
  HS.py



1 import numpy as np
2 from HSIndividual import HSIndividual
3 import random
4 import copy
5 import math
6 import matplotlib.pyplot as plt
7
8
9 class HarmonySearch:
10
11   '''
12   the class for harmony search algorithm
13   '''
14
15   def __init__(self, sizepop, vardim, bound, MAXGEN, params):
16         '''
17         sizepop: population sizepop
18         vardim: dimension of variables
19         bound: boundaries of variables
20         MAXGEN: termination condition
21         params: algorithm required parameters, it is a list which is consisting of
22         '''
23         self.sizepop = sizepop
24         self.vardim = vardim
25         self.bound = bound
26         self.MAXGEN = MAXGEN
27         self.params = params
28         self.population = []
29         self.fitness = np.zeros((self.sizepop, 1))
30         self.trace = np.zeros((self.MAXGEN, 2))
31
32   def initialize(self):
33         '''
34         initialize the population of hs
35         '''
36         for i in xrange(0, self.sizepop):
37             ind = HSIndividual(self.vardim, self.bound)
38             ind.generate()
39             self.population.append(ind)
40
41   def evaluation(self):
42         '''
43         evaluation the fitness of the population
44         '''
45         for i in xrange(0, self.sizepop):
46             self.population.calculateFitness()
47             self.fitness = self.population.fitness
48
49   def improvise(self):
50         '''
51         improvise a new harmony
52         '''
53         ind = HSIndividual(self.vardim, self.bound)
54         ind.chrom = np.zeros(self.vardim)
55         for i in xrange(0, self.vardim):
56             if random.random() < self.params:
57               if random.random() < self.params:
58                     ind.chrom += self.best.chrom
59               else:
60                     worstIdx = np.argmin(self.fitness)
61                     xr = 2 * self.best.chrom - \
62                         self.population.chrom
63                     if xr < self.bound:
64                         xr = self.bound
65                     if xr > self.bound:
66                         xr = self.bound
67                     ind.chrom = self.population.chrom[
68                         i] + (xr - self.population.chrom) * random.random()
69             else:
70               ind.chrom = self.bound[
71                     0, i] + (self.bound - self.bound) * random.random()
72         ind.calculateFitness()
73         return ind
74
75   def update(self, ind):
76         '''
77         update harmony memory
78         '''
79         minIdx = np.argmin(self.fitness)
80         if ind.fitness > self.population.fitness:
81             self.population = ind
82             self.fitness = ind.fitness
83
84   def solve(self):
85         '''
86         the evolution process of the hs algorithm
87         '''
88         self.t = 0
89         self.initialize()
90         self.evaluation()
91         best = np.max(self.fitness)
92         bestIndex = np.argmax(self.fitness)
93         self.best = copy.deepcopy(self.population)
94         self.avefitness = np.mean(self.fitness)
95         self.trace = (1 - self.best.fitness) / self.best.fitness
96         self.trace = (1 - self.avefitness) / self.avefitness
97         print("Generation %d: optimal function value is: %f; average function value is %f" % (
98             self.t, self.trace, self.trace))
99         while self.t < self.MAXGEN - 1:
100             self.t += 1
101             ind = self.improvise()
102             self.update(ind)
103             best = np.max(self.fitness)
104             bestIndex = np.argmax(self.fitness)
105             if best > self.best.fitness:
106               self.best = copy.deepcopy(self.population)
107             self.avefitness = np.mean(self.fitness)
108             self.trace = (1 - self.best.fitness) / self.best.fitness
109             self.trace = (1 - self.avefitness) / self.avefitness
110             print("Generation %d: optimal function value is: %f; average function value is %f" % (
111               self.t, self.trace, self.trace))
112         print("Optimal function value is: %f; " % self.trace)
113         print "Optimal solution is:"
114         print self.best.chrom
115         self.printResult()
116
117   def printResult(self):
118         '''
119         plot the result of abs algorithm
120         '''
121         x = np.arange(0, self.MAXGEN)
122         y1 = self.trace[:, 0]
123         y2 = self.trace[:, 1]
124         plt.plot(x, y1, 'r', label='optimal value')
125         plt.plot(x, y2, 'g', label='average value')
126         plt.xlabel("Iteration")
127         plt.ylabel("function value")
128         plt.title("Harmony search algorithm for function optimization")
129         plt.legend()
130         plt.show()
  运行程序:



1 if __name__ == "__main__":
2
3   bound = np.tile([[-600], ], 25)
4   hs = HS(60, 25, bound, 5000, )
5   hs.solve()
  ObjFunction见简单遗传算法-python实现。
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