用python计算lda语言模型的困惑度并作图

hao0089

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　　困惑度一般在自然语言处理中用来衡量训练出的语言模型的好坏。在用LDA做主题和词聚类时，原作者D.Blei就是采用了困惑度来确定主题数量。文章中的公式为：
　　perplexity=exp^{ - (∑log(p(w))) / (N) }
　　其中，P(W)是指的测试集中出现的每一个词的概率，具体到LDA的模型中就是P(w)=∑z p(z|d)*p(w|z)【z,d分别指训练过的主题和测试集的各篇文档】。分母的N是测试集中出现的所有词，或者说是测试集的总长度，不排重。
　　因而python程序代码块需要包括几个方面：
　　1.对训练的LDA模型，将Topic-word分布文档转换成字典，方便查询概率，即计算perplexity的分子
　　2.统计测试集长度，即计算perplexity的分母
　　3.计算困惑度
　　4.对于不同的Topic数量的模型，计算的困惑度，画折线图。
　　python代码如下：
　　



1 # -*- coding: UTF-8-*-
2 import numpy
3 import math
4 import string
5 import matplotlib.pyplot as plt
6 import re
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8 def dictionary_found(wordlist):               #对模型训练出来的词转换成一个词为KEY,概率为值的字典。
9     word_dictionary1={}
10     for i in xrange(len(wordlist)):
11         if i%2==0:
12             if word_dictionary1.has_key(wordlist)==True:
13                 word_probability=word_dictionary1.get(wordlist)
14                 word_probability=float(word_probability)+float(wordlist[i+1])
15                 word_dictionary1.update({wordlist:word_probability})
16             else:
17                 word_dictionary1.update({wordlist:wordlist[i+1]})
18         else:
19             pass
20     return word_dictionary1
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22 def look_into_dic(dictionary,testset):          #对于测试集的每一个词，在字典中查找其概率。
23     '''Calculates the TF-list for perplexity'''   
24     frequency=[]
25     letter_list=[]
26     a=0.0
27     for letter in testset.split():
28         if letter not in letter_list:
29             letter_list.append(letter)
30             letter_frequency=(dictionary.get(letter))
31             frequency.append(letter_frequency)
32         else:
33             pass
34     for each in frequency:
35         if each!=None:
36             a+=float(each)
37         else:
38             pass
39     return a
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42 def f_testset_word_count(testset):                                     #测试集的词数统计
43     '''reture the sum of words in testset which is the denominator of the formula of Perplexity'''
44     testset_clean=testset.split()
45     return (len(testset_clean)-testset.count("\n"))
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47 def f_perplexity(word_frequency,word_count):             #计算困惑度
48     '''Search the probability of each word in dictionary
49     Calculates the perplexity of the LDA model for every parameter T'''
50     duishu=-math.log(word_frequency)
51     kuohaoli=duishu/word_count
52     perplexity=math.exp(kuohaoli)
53     return perplexity
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55 def graph_draw(topic,perplexity):             #做主题数与困惑度的折线图
56     x=topic
57     y=perplexity
58     plt.plot(x,y,color="red",linewidth=2)
59     plt.xlabel("Number of Topic")
60     plt.ylabel("Perplexity")
61     plt.show()
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64 topic=[]
65 perplexity_list=[]
66 f1=open('/home/alber/lda/GibbsLDA/jd/test.txt','r')      #测试集目录
67 testset=f1.read()
68 testset_word_count=f_testset_word_count(testset)         #call the function to count the sum-words in testset
69 for i in xrange(14):
70     dictionary={}
71     topic.append(5*(3i+1))                                                       #模型文件名的迭代公式
72     trace="/home/alber/lda/GibbsLDA/jd/stats/model-final-"+str(5*(i+1))+".txt"   #模型目录
73     f=open(trace,'r')
74     text=f.readlines()
75     word_list=[]
76     for line in text:
77         if "Topic" not in line:
78             line_clean=line.split()
79             word_list.extend(line_clean)   
80         else:
81             pass
82     word_dictionary=dictionary_found(word_list)
83     frequency=look_into_dic(word_dictionary,testset)      
84     perplexity=f_perplexity(frequency,testset_word_count)      
85     perplexity_list.append(perplexity)        
86 graph_draw(topic,perplexity_list)
　　下面是画出的折线图，在拐点附近再调整参数（当然与测试集有关，有图为证～～），寻找最优的主题数。实验证明，只要Topic选取数量在其附近，主题抽取一般比较理想。

　　
　　
　　本人也是新手开始作研究～程序或者其他地方有错误的，希望大家指正。