RHadoop计算平台搭建

3weq

doop平台上构建R一、安装R
　　（1）安装依赖软件
　　　　sudo yum install gcc-gfortran
　　　　sudo yum install gcc gcc-c++  
　　　　sudo yum install readline-devel  
　　　　sudo yum install libXt-devel  

　　（2）安装R包
　　　　cd /home/hdp/download　　
　　　　wget http://mirror.bjtu.edu.cn/cran/src/base/R-3/R-3.1.0.tar.gz
　　　　tar zxvf R-3.1.0.tar.gz
　　　　cd R-3.1.0
　　　　./configure --enable-R-shlib

　　　　sudo make
　　　　sudo make install
　　　　把R、Rscript加入环境变量
　　　　sudo ln -s /usr/local/bin/Rscript /usr/bin/Rscript

　　　　sudo ln -s /usr/local/bin/R /usr/bin/R

　　在linux终端输入R，如果启动正常则表明安装成功
　　


二、安装RStudio
　　为了更方便把RHadoop提供给开发人员使用，可以使用基于Web操作的RStudio来操作R
　　cd /home/hdp/download　　
　　wget http://download2.rstudio.org/rstudio-server-0.98.953-x86_64.rpm
　　sudo yum install libcrypto.so.6
　　sudo yum install libgfortran.so.1
　　sudo yum install libssl.so.6
　　sudo yum install openssl098e-0.9.8e
　　sudo yum install gcc41-libgfortran-4.1.2
　　sudo yum install pango-1.28.1
　　sudo yum install compat-libgfortran
　　cd /etc/ld.so.conf.d/
　　sudo vim rstudio.conf添加内容
　　　　/usr/local/lib64/R/lib
　　再执行sudo ldconfig将下面几个so库加入系统库
　　
　　sudo rpm -Uvh --nodeps rstudio-server-0.98.953-x86_64.rpm　　
　　至此rstudio安装完成并启动，运行rstudio-server verify-installation看是否会报错
　　最后，可以进入/etc/rstudio目录修改rserver.conf配置文件添加登录权限管理
　　
　　auth-required-usr-group是针对设置的组才能登录系统。注意：rstudio用户是和linux本地帐号一致的，对于ldap用户是不支持的。
　　访问8787端口就能进入rstudio web界面了：
　　　　　

三、安装RHadoop　
　　1、下载rmr、rhdfs
　　       进入https://github.com/RevolutionAnalytics/RHadoop/wiki/Downloads下载rmr、rhdfs包
　　2、安装rmr、rhdfs
　　　　cmd执行命令行执行：　　
　　　　　　R CMD javareconf 　　
　　　　启动R执行：
　　　　　　install.packages("rJava")
　　　　　　install.packages("reshape2")
　　　　　　install.packages("Rcpp")
　　　　　　install.packages("iterators")
　　　　　　install.packages("itertools")
　　　　　　install.packages("digest")
　　　　　　install.packages("RJSONIO")
　　　　　　install.packages("functional")
　　　　cmd执行命令行执行：
　　　　R CMD INSTALL rhdfs-1.0.8.tar.gz
　　　　R CMD INSTALL rmr-3.1.2.tar.gz
　　3、修改环境变量
　　　cd /usr/local/lib64/R/etc
　　　修改Renviron文件增加HADOOP_CMD、HADOOP_STREAMING环境变量，这步很关键不然RStudio会报错获取不到HADOOP环境变量
　　　
　4、部署DataNode
　　　将/usr/local/lib64/R目录下所有文件传至所有DataNode节点相同位置
　　　sudo cp /usr/local/lib64/R/bin/R /usr/local/bin/
　　   sudo cp /usr/local/lib64/R/bin/Rscript /usr/local/bin/　
　　  至此完成了RHadoop平台部署