Cloudera Hadoop CDH上安装R及RHadoop(rhdfs/rmr2/rhbase/RHive)

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　　转自：http://www.geedoo.info/installed-on-the-cloudera-hadoop-cdh-r-and-rhadoop-rhdfs-rmr2-rhbase-rhive.html
　　前言：RHadoop是由Revolution Analytics发起的一个开源项目，它可以将统计语言R与Hadoop结合起来。目前该项目包括三个R packages，分别为支持用R来编写MapReduce应用的rmr、用于R语言访问HDFS的rhdfs以及用于R语言访问HBASE的rhbase。
一、系统及所需软件版本
　　服务器操作系统：CentOS 6.3
　　R语言版本：R-2.15.3 (先前使用过R-3的最新版，发现新版本存在各种不兼容的问题，因此选择了R-2的最新版)
　　下载地址：http://ftp.ctex.org/mirrors/CRAN/src/base/R-2/R-2.15.3.tar.gz
　　Cloudera Hadoop CDH版本：4.4.0
　　JDK版本：1.6.0_31
　　使用Cloudera Manager 免费版的安装包cloudera-manager-installer.bin，即可完成CDH和JDK的安装，具体详见CDH的安装
　　下载地址：https://ccp.cloudera.com/display/SUPPORT/Cloudera+Manager+Free+Edition+Download
　　rJava（是java可以调用R，可使用CRAN安装）版本：rJava_0.9-5
　　下载地址：http://www.rforge.net/src/contrib/rJava_0.9-5.tar.gz
　　RHadoop版本，为官方最新版本，项目地址（https://github.com/RevolutionAnalytics），包含项目具体如下：

• rmr-2.2.2
  
• rhdfs-1.0.6
  
• rhbase-1.2.0
  

　　下载地址：https://github.com/RevolutionAnalytics/RHadoop/wiki/Downloads
　　说明文档：https://github.com/RevolutionAnalytics/RHadoop/wiki
二、依赖安装（R语言包、rJava包）
　　在安装之前需要在集群各个主机上逐个安装R语言包、rJava包，然后再进行Rhadoop的安装。具体安装步骤如下：
1、安装R语言包
　　在编译R之前，需要通过yum安装以下几个程序：

　　# yum install gcc-gfortran

　　否则报”configure: error: No F77 compiler found”错误

　　# yum install gcc gcc-c++

　　否则报”configure: error: C++ preprocessor “/lib/cpp” fails sanity check”错误

　　# yum install readline-devel

　　否则报”–with-readline=yes (default) and headers/libs are not available”错误

　　# yum install libXt-devel

　　否则报”configure: error: –with-x=yes (default) and X11 headers/libs are not available”错误
　　然后下载源代码,编译

　　# wget http://cran.rstudio.com/src/base/R-2/R-2.15.3.tar.gz
　　# tar -zxvf R-2.15.3.tar.gz
　　# cd R-2.15.3
　　# ./configure –prefix=/usr –disable-nls –enable-R-shlib/** (后面两个选项–disable-nls –enable-R-shlib是为RHive的安装座准备，如果不安装RHive可以省去)*/
　　# make
　　# make install